Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms