Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxraP28700 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
RxraP28700 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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