Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms