Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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