Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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