Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PparaP23204 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PparaP23204 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PparaP23204 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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