Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms