Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P20040 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P20040 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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