Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfaP20033 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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