Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NefhP19246 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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