Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifrd1P19182 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifrd1P19182 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms