Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lama1P19137 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lama1P19137 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms