Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms