Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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PcnaP17918 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PcnaP17918 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms