Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms