Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms