Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl1P10146 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl1P10146 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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