Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms