Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms