Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01820 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01820 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01820 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01820 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01820 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01820 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01820 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01820 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01820 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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