Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01789 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01789 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01789 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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