Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01641 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01641 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01641 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01641 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01641 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01641 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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