Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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