Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms