Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Smarce1O54941 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarce1O54941 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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