Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms