Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms