Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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