Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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MttpO08601 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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