Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8050L7N2E3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms