Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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