Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms