Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms