Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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