Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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