Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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