Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms