Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LctF8VPT3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms