Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms