Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms