Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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