Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms