Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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