Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pate1E9Q658 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Pate1E9Q658 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pate1E9Q658 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pate1E9Q658 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pate1E9Q658 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pate1E9Q658 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate1E9Q658 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pate1E9Q658 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms