Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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