Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fndc1E9Q043 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms