Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms