Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms