Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Triml2E9PW10 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Triml2E9PW10 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms