Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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